Važno je naglasiti da adaptirana mlijeka prolaze kroz mnoge procese tijekom proizvodnje u kojoj se kravlje mlijeko mijenja i obogaćuje različitim dodacima. Kao i sva ostala industrijski proizvedena dječja hrana, i adaptirana mlijeka su izložena onečišćenju zbog zagađene sredine u kojoj je nastaju, a onečišćenja su moguća i tijekom samog procesa proizvodnje. Također, adaptirana mlijeka uključuju i rizik od pogrešaka u proizvodnji, za razliku od majčinog mlijeka koje nikad neće biti povučeno iz prodaje zbog - pogreške u proizvodnji. Dok majčino mlijeko sasvim sigurno sadrži određenu razinu organskih onečišćenja, industrijski proizvedeni nadomjesci majčinome mlijeku se, prema analizama, povezuju i sa visokom razinom teških metala, fitoestrogena i bakterija.